More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2728 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  313  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.91 
 
 
159 aa  194  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.3 
 
 
160 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 
157 aa  157  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
251 aa  155  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
250 aa  152  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.02 
 
 
255 aa  147  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
167 aa  147  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 
156 aa  140  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 
154 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
161 aa  137  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.22 
 
 
164 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
264 aa  130  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 
255 aa  127  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
166 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
173 aa  113  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.72 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.62 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.75 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.15 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 
203 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  46.38 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
218 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  46.38 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  46.38 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  46.38 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  46.38 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.93 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  42.19 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  32.73 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.23 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  29.75 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  46.15 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  46.15 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  25.21 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.45 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.45 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
157 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.41 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  28.24 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  26.15 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  28.45 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  26.15 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  33.66 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.23 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.59 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.59 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>