More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2283 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
160 aa  327  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  69.43 
 
 
157 aa  236  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.3 
 
 
156 aa  161  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 
158 aa  154  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
164 aa  154  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
159 aa  147  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
167 aa  143  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 
255 aa  141  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
250 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
166 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
157 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
154 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
156 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
173 aa  122  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
255 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
264 aa  114  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.35 
 
 
134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  39.76 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  28.91 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.09 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  44.78 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
203 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.97 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  35.83 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  34.09 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  27.12 
 
 
180 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  27.12 
 
 
180 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  27.12 
 
 
180 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  45.59 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  34.43 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  45.59 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  49.18 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  43.94 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  33.66 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  29.77 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  35.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  35.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  35.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  28.07 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  45.9 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  37.84 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  40.91 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>