163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1748 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 173 aa  154  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.15 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 251 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 		 250 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.64 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 255 aa  98.2  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.16 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 		 264 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 		 255 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  25.19 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  25.44 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  25.44 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  29.91 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  25.36 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  34.94 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.3 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.22 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.66 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  26.96 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  26.96 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  42.37 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  25 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  47.73 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  52.08 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  26.96 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  24.56 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  35.09 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  24.07 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  22.69 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  33.03 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  28.43 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  21.38 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  23.24 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  31.48 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  21.36 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  33.93 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  31.48 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  24.84 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  27.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>