More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3080 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4058  transcriptional regulator, AsnC family  52.47 
 
 
167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  52.8 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1306  transcriptional regulator, AsnC family  47.56 
 
 
183 aa  164  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1838  transcriptional regulator, AsnC family  51.32 
 
 
162 aa  157  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1471  transcriptional regulator, AsnC family  48.45 
 
 
160 aa  156  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  33.13 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  30.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  30.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  30.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  30.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.61 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.5 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  27.14 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  23.45 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
174 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  26.43 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
180 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  23.13 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  24.39 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  26.06 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  24.31 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  22.7 
 
 
174 aa  54.3  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  26.67 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  24.09 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 
157 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
156 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  25.18 
 
 
160 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
155 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
165 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  25.71 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4644  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.94976  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
192 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  23.97 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  24.46 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1156  transcriptional regulator  31.78 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.675806  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  22.7 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  24.14 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  25.5 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  24.68 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  25.32 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  21.62 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  28 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  21.62 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  21.62 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  21.62 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  32.77 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.06 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.14 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>