More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1838 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1838  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 162 aa  317  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1471  transcriptional regulator, AsnC family  70.62 
 
 		 160 aa  223  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  51.22 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  50.62 
 
 		 173 aa  163  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4058  transcriptional regulator, AsnC family  46.91 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1306  transcriptional regulator, AsnC family  44.1 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  31.68 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  24.29 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.26 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  21.77 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  26.35 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  29.75 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  24.8 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0410  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  22.06 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  24.26 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25.68 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  22.76 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  27.83 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  25.34 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  24.14 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  23.48 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  25.22 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  24.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  24.35 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  26.96 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  22.63 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  29.09 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  25.47 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.87 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  22.76 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>