More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3937 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
166 aa  328  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  67.07 
 
 
164 aa  228  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
173 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4058  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 
167 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1306  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
183 aa  90.9  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1471  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
160 aa  84.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1838  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  29.17 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  30.57 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  30.82 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  26.45 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2377  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.830552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  26.45 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  26.45 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1156  transcriptional regulator  27.21 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.675806  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  26.49 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  27.15 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  26.28 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  27.97 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  25.68 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  29.37 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  29.37 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  30.3 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  25.66 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  25.66 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1755  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0468  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.674302  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  25.66 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  25.66 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.16 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  29.37 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  29.37 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  26 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  26.32 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  25.66 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>