More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1471 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1471  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
160 aa  313  8e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1838  transcriptional regulator, AsnC family  70.47 
 
 
162 aa  208  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1306  transcriptional regulator, AsnC family  49.07 
 
 
183 aa  166  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4058  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 
167 aa  163  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  48.45 
 
 
166 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  51.03 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  23.13 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  21.68 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  23.13 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  21.77 
 
 
174 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  25.83 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  24.83 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.45 
 
 
158 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  23.97 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  22.15 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  27.64 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  27.64 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  23.49 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  23.29 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  21.74 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  27.87 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  27.92 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.01 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  32.2 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.74 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.2 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  25 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  22.82 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
157 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  23.49 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  26.83 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  25.49 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  22.82 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
150 aa  53.9  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.55 
 
 
154 aa  53.9  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  26.62 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  23.65 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  23.65 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  25.5 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>