More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1956 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  307  4e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  75 
 
 
157 aa  249  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
153 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
151 aa  94.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
156 aa  94  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
152 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.27 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  30.92 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  33.11 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.11 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  31.9 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.77 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>