More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4777 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  87.58 
 
 
154 aa  271  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  80.39 
 
 
154 aa  251  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  73.68 
 
 
152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  73.86 
 
 
153 aa  236  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  71.71 
 
 
152 aa  235  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  71.9 
 
 
153 aa  229  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 
151 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 
152 aa  130  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  24.11 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  27.82 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  30.37 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  23.7 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  22.92 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  24.46 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  27.97 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  24.26 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.64 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  27.66 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
156 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  27.66 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  27.66 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  27.66 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  23.02 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  24.31 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  25.56 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.14 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  27.07 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  29.79 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  29.79 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  25.87 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  24.63 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  31.31 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  24.06 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4644  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.94976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>