More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1485 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  69.28 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  63.29 
 
 		 160 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  70.07 
 
 		 159 aa  203  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  68.71 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  68.03 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  61.03 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  61.03 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  53.55 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 155 aa  151  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  38.99 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 155 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.27 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.51 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  30.5 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.79 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  30.41 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  33.33 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  27.21 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  29.01 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>