More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0181 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 168 aa  329  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 161 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  38.64 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.24 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  27.34 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.71 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  30.99 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  30.99 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  30.99 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.94 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  29.23 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>