More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4348 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 160 aa  316  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  69.78 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  38.99 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  45.11 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  40.58 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.81 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 173 aa  97.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  33.54 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  32.86 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.45 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  31.94 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.91 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>