More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4110 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  306  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  51.95 
 
 		 167 aa  153  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  52.63 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.8 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.31 
 
 		 188 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.84 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  50.74 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  47.41 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  39.82 
 
 		 149 aa  84  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  26.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  26.97 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  34.39 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  34.39 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  34.39 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>