More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4434 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  310  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
157 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  50.65 
 
 
155 aa  140  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  48.08 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  48.15 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
167 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.04 
 
 
159 aa  101  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
168 aa  101  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
152 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
167 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 
161 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
158 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
157 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.97 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  29.75 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  24.26 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  29.5 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  27.92 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  32.35 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
172 aa  57.8  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  28.76 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.65 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  30.83 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  32.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  32.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  32.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  32.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  32.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  30.72 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  24 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
154 aa  53.9  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
142 aa  53.9  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  24.63 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>