More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8543 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
159 aa  309  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
154 aa  244  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  71.52 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  70.27 
 
 
160 aa  209  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  70.07 
 
 
169 aa  203  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  68.67 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  66.22 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  65.54 
 
 
188 aa  194  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  59.48 
 
 
156 aa  170  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  63.31 
 
 
173 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  56 
 
 
165 aa  153  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  61.65 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
156 aa  148  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.7 
 
 
157 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 
155 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 
172 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
167 aa  121  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  41.14 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
157 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 
155 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 
157 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 
157 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
152 aa  94  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
152 aa  89  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
155 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  27.15 
 
 
155 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
170 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
170 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  28.97 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  38.73 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.97 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.77 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.7 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.21 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.7 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  43.27 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>