More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4176 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  62.25 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  65.54 
 
 
155 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  60.81 
 
 
156 aa  191  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 
155 aa  183  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  48.08 
 
 
156 aa  165  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  50.68 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48 
 
 
153 aa  151  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  50.68 
 
 
153 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
156 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 
156 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.94 
 
 
153 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48 
 
 
153 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  50.34 
 
 
153 aa  147  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48 
 
 
153 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48 
 
 
153 aa  147  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48.97 
 
 
154 aa  146  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.59 
 
 
153 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.26 
 
 
154 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.59 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.59 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.59 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
153 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
164 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
164 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
164 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
153 aa  144  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
153 aa  144  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
164 aa  143  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.26 
 
 
153 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  46.58 
 
 
154 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.21 
 
 
153 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.21 
 
 
153 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.52 
 
 
153 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.98 
 
 
153 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.67 
 
 
152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46 
 
 
152 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  46.67 
 
 
152 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46 
 
 
152 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46 
 
 
152 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.26 
 
 
150 aa  133  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  41.26 
 
 
160 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 
168 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
149 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 
164 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
140 aa  84  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>