More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0826 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
164 aa  340  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
164 aa  340  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
164 aa  340  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  98.17 
 
 
164 aa  336  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  97.56 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  97.56 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  97.56 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  100 
 
 
153 aa  318  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  97.39 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  95.42 
 
 
153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  93.46 
 
 
153 aa  303  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.81 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  93.46 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.81 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  94.12 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  92.16 
 
 
153 aa  298  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
153 aa  243  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.16 
 
 
153 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
153 aa  242  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  74.51 
 
 
153 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.86 
 
 
153 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
154 aa  240  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  238  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  238  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  73.2 
 
 
153 aa  238  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.4 
 
 
152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
152 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
152 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
152 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
152 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  75.17 
 
 
152 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  77.4 
 
 
152 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  70.59 
 
 
153 aa  230  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.97 
 
 
153 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  68.49 
 
 
154 aa  217  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.81 
 
 
154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  67.12 
 
 
150 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
156 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
156 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  47.59 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  44.83 
 
 
156 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
156 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 
156 aa  134  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
155 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
155 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  35.66 
 
 
160 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
149 aa  106  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
159 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
158 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.67 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  35.83 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>