More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0286 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
160 aa  316  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  69.93 
 
 
154 aa  217  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  70.27 
 
 
159 aa  209  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 
158 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  63.29 
 
 
169 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  65.16 
 
 
188 aa  203  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 
178 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 
155 aa  190  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  59.21 
 
 
156 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  52.29 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  48.7 
 
 
156 aa  156  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 
155 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
158 aa  147  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  49.41 
 
 
173 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  54.23 
 
 
155 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 
172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.2 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
157 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
161 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
170 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 
159 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
157 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
157 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
169 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 
152 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  30.13 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  33.33 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  39.55 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.72 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.8 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>