More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4249 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  90.17 
 
 
178 aa  301  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  68.87 
 
 
158 aa  207  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  65.16 
 
 
160 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  68.71 
 
 
169 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 
155 aa  201  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 
154 aa  201  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  65.54 
 
 
159 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  58.67 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  62.68 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  56.29 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.42 
 
 
157 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  59.26 
 
 
155 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
156 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
155 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.31 
 
 
158 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 
167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
167 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 
161 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
170 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
157 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 
152 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
168 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
155 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
169 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 
157 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
160 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 
159 aa  94.4  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
156 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  28.57 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
157 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.33 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.33 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
155 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.03 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.67 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.33 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.73 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.05 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.05 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.05 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  35.21 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.35 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.67 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>