More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1925 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  49.33 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  43.62 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  33.54 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  39.5 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  35.04 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.14 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.07 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.54 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  35.42 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  33.77 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.41 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>