More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3107 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  85.14 
 
 		 159 aa  244  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  75.66 
 
 		 158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  69.93 
 
 		 160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  69.74 
 
 		 169 aa  209  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  66.01 
 
 		 178 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  65.36 
 
 		 188 aa  201  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 		 155 aa  197  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  60.53 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  63.24 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  61.03 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  55.7 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  50.66 
 
 		 172 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.62 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.57 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.29 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  32.39 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  40.44 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.14 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.21 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>