More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1625 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  312  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  98.72 
 
 
156 aa  310  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.02 
 
 
153 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 
155 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.68 
 
 
153 aa  150  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  49.66 
 
 
157 aa  150  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  50.68 
 
 
153 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.36 
 
 
153 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.36 
 
 
153 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 
156 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.36 
 
 
153 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.36 
 
 
153 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.36 
 
 
153 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  46.21 
 
 
154 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  148  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.37 
 
 
153 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.05 
 
 
164 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.7 
 
 
153 aa  147  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.7 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.52 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.92 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48.3 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  49.66 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  51.37 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48.98 
 
 
153 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  48.98 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 
158 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.26 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  47.95 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  46.9 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  41.67 
 
 
156 aa  130  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  40.14 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
159 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
150 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
155 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
140 aa  92  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
140 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
158 aa  84  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
167 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>