More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2721 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
158 aa  326  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  79.87 
 
 
156 aa  260  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 
155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  62.25 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  55.26 
 
 
155 aa  190  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
156 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  48.97 
 
 
156 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
156 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
156 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.3 
 
 
153 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.3 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.21 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.21 
 
 
153 aa  134  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.67 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.67 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.15 
 
 
153 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.15 
 
 
153 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.15 
 
 
153 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.83 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.67 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.67 
 
 
153 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.67 
 
 
153 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.95 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.95 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.95 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.52 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40 
 
 
153 aa  130  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.41 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.67 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.06 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  39.73 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.95 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  39.73 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.95 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.97 
 
 
153 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
152 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.45 
 
 
154 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  38.89 
 
 
160 aa  122  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
159 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
155 aa  121  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 
168 aa  117  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
149 aa  101  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
174 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
169 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.33 
 
 
148 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 
160 aa  90.5  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
148 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
148 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
163 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
151 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 
157 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
156 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
162 aa  84  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.08 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>