More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2564 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
161 aa  317  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  83.54 
 
 
170 aa  276  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
158 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 
155 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
157 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
178 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.94 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
155 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
160 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 
160 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
152 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
157 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
172 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
157 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
157 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
156 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
157 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
168 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 
155 aa  97.4  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 
157 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  38.35 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
155 aa  84  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.88 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.17 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  28.37 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  36.22 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  34.65 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  26.47 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  34.04 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.43 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>