More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1398 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
157 aa  314  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  92.21 
 
 
157 aa  285  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  59.7 
 
 
157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  51.61 
 
 
155 aa  154  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
157 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 
158 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
155 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
169 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
158 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 
152 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.06 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
160 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
158 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
178 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
157 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
161 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 
170 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 
159 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
155 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
173 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  38.81 
 
 
155 aa  97.1  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
168 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
172 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.25 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.56 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.33 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.78 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  33.04 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  29.92 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  34.35 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3088  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.17 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>