More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0849 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  84.34 
 
 
167 aa  294  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  83.83 
 
 
167 aa  292  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  78.44 
 
 
168 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  48.47 
 
 
164 aa  166  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
170 aa  100  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
149 aa  87.4  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  32.7 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  34.15 
 
 
164 aa  84.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 
157 aa  84  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  32.93 
 
 
164 aa  84  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  33.11 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  31.41 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  31.41 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.91 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  32.89 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  31.58 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.24 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  32.3 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  29.75 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  29.11 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  33.59 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  30.92 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.46 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  29.76 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.46 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  32.73 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  29.49 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.24 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.46 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  30.86 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.92 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  30.13 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>