More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0022 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
164 aa  332  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
156 aa  103  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
155 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
152 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.06 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  33.57 
 
 
156 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
152 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
152 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
152 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
156 aa  91.3  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.17 
 
 
153 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
153 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  89  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  37.6 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
153 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
154 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
152 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 
156 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
158 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.14 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.69 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
153 aa  84  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
159 aa  84.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
162 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.94 
 
 
150 aa  84.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
151 aa  84  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
164 aa  84  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
166 aa  84  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.37 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  31.41 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  32.88 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  32.88 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  32.88 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>