More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0452 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  289  8e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.13 
 
 
162 aa  196  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  65.28 
 
 
156 aa  194  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  62.94 
 
 
152 aa  183  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  62.24 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  58.33 
 
 
151 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  57.64 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  57.34 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  58.45 
 
 
156 aa  169  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 
156 aa  167  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
146 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 
148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
148 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 
148 aa  157  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
148 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
156 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 
163 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  52.08 
 
 
149 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  50.7 
 
 
154 aa  140  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  50.7 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  43.48 
 
 
144 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  42.34 
 
 
153 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
160 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
157 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
175 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.34 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.17 
 
 
156 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 
155 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  33.56 
 
 
162 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
153 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  34.59 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  34.59 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.02 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
153 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  33.96 
 
 
171 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  33.96 
 
 
171 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  33.96 
 
 
171 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  33.96 
 
 
171 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
171 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  33.96 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  40.83 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
173 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  35.37 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  38.79 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>