More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4114 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.65 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.57 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  40.98 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 182 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  38.4 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.29 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  36.23 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 175 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  34.01 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  34.53 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  36.22 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  32.64 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>