More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2378 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  330  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  92.86 
 
 		 165 aa  300  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  68.75 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 182 aa  203  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  68.09 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  66.44 
 
 		 151 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  65.07 
 
 		 149 aa  193  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  61.35 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 147 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  61.04 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 150 aa  183  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  65.49 
 
 		 161 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  53.57 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 144 aa  114  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  42.14 
 
 		 153 aa  114  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.97 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.29 
 
 		 144 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 149 aa  88.2  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  41.46 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  38.84 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.71 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  39.53 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  38.71 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.9 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>