More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1271 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  86.16 
 
 
160 aa  247  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  83.56 
 
 
150 aa  246  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  79.74 
 
 
156 aa  228  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  76.73 
 
 
159 aa  225  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  62.41 
 
 
152 aa  173  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  59.15 
 
 
149 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  60.56 
 
 
182 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  59.15 
 
 
151 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 
158 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  62.6 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 
147 aa  160  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  56.12 
 
 
143 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  56.34 
 
 
165 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 
168 aa  157  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 
156 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  53.42 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  53.95 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  53.24 
 
 
144 aa  137  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
153 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 
152 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  40.37 
 
 
167 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
156 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 
164 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.76 
 
 
152 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 
145 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
164 aa  84  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  34.59 
 
 
164 aa  84  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  33.96 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  35.22 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.86 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  35.94 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.76 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  34.01 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  36.36 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  35.46 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  34.9 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  37.3 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  35.46 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  35.71 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  34 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>