More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3305 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 148 aa  293  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  54.23 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  54.11 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  48.95 
 
 		 151 aa  147  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.65 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  48.25 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  46.48 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.24 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  39.29 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  39.29 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  33.1 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.45 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.88 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 		 172 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>