More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1538 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 152 aa  303  7e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  86.18 
 
 		 152 aa  267  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  76.32 
 
 		 154 aa  243  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 		 153 aa  243  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  71.71 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  74.34 
 
 		 154 aa  234  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  74.34 
 
 		 153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  46.09 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  31.51 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  28.36 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.83 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.38 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  25.87 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.9 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  27.89 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  27.89 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  27.89 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  36.89 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  31.43 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  31.43 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.82 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  31.19 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  27.21 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  28.47 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.24 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  31.31 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.45 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  28.89 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>