More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3016 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  304  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  84.21 
 
 		 154 aa  261  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  76.97 
 
 		 152 aa  244  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  76.97 
 
 		 154 aa  239  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  73.86 
 
 		 153 aa  236  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  76.32 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  74.34 
 
 		 152 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  45.38 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  33.67 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  33.67 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  24.31 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.38 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  29.79 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  29.79 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  29.79 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  29.79 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  24.66 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  28.36 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  32.12 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>