More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3532 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  99.29 
 
 		 140 aa  279  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  97.86 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  67.14 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 175 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  51.43 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  49.64 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 141 aa  129  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  51.8 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  51.08 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.08 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  48.92 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  44.78 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  40.15 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 193 aa  95.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 193 aa  95.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 295 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 159 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  38.35 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.33 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  31.11 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>