More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0402 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
143 aa  286  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  47.86 
 
 
140 aa  143  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
140 aa  137  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
167 aa  127  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
140 aa  118  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
140 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
142 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
142 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
142 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
142 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  34.78 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  30.51 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  30.51 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.06 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.37 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.37 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.37 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.37 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.37 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
174 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  25.2 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
174 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>