More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3000 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  69.43 
 
 		 160 aa  236  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 		 255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 250 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 264 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.15 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  34.45 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.59 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.33 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.45 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.5 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0342  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0349  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  25.78 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  32.76 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  34.38 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.94 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  29.13 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  31.01 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>