More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3161 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  70.85 
 
 
251 aa  355  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.11 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.79 
 
 
255 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.41 
 
 
255 aa  228  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 
159 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.68 
 
 
164 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 
167 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
158 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
160 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
157 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
156 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
154 aa  111  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
161 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 
155 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
166 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
173 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  43.21 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  39.33 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  41.25 
 
 
229 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 
158 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  31.09 
 
 
152 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 
153 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  36.22 
 
 
169 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
153 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  44.26 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.09 
 
 
153 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
157 aa  52.4  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
153 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  28.18 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
167 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  26.79 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 
155 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 
155 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
159 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  31.09 
 
 
157 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  45.61 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  42.37 
 
 
155 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  43.1 
 
 
149 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  36.07 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  27.82 
 
 
160 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
167 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  27.87 
 
 
152 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 
147 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 
150 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.56 
 
 
151 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
174 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  27.89 
 
 
166 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
171 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
169 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 
154 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.18 
 
 
150 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  41.07 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
157 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
160 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.4 
 
 
153 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
143 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
150 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
150 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
162 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 
181 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
217 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
150 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  31.78 
 
 
170 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  30.4 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  44.64 
 
 
170 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  43.28 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.92 
 
 
157 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>