More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0797 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  542  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0832  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0391  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0364  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.71 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0428  AsnC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.717716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1715  AsnC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.128343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  37.7 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  40.98 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  40.98 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  40.98 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  40.98 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 157 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 159 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 171 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  23.73 
 
 		 327 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.7 
 
 		 167 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 167 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 150 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 150 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 150 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 158 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.71 
 
 		 148 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 167 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 166 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 167 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 145 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 153 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  38.6 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 170 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 170 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  30.34 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  30.34 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 165 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  29.69 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  26.81 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  26.81 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  31 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  47.92 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  30.49 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 167 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.12 
 
 		 152 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>