178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1134 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 327 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 485 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  41.19 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  44.82 
 
 		 296 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  38.53 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  31.8 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.44 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  27.25 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.62 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.58 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  24.15 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 173 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  27.1 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  28.07 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  27.19 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  27.19 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  28.85 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  27.19 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 150 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 171 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 171 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 161 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 265 aa  53.1  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  28.16 
 
 		 148 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.11 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  29.56 
 
 		 157 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 		 167 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 168 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.58 
 
 		 164 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 173 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.63 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 167 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 155 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  21.43 
 
 		 140 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.91 
 
 		 162 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  25.51 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  18.57 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.84 
 
 		 152 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.29 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 172 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 172 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 172 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 		 156 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 153 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  23.02 
 
 		 153 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>