123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0030 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 343 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  34.16 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  29.77 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  27.25 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  28.92 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  29.59 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  33.97 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  34.62 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  22.56 
 
 		 143 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 170 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 154 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  23.46 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 		 153 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 154 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  22.4 
 
 		 155 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 152 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  28.66 
 
 		 171 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 140 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  22.14 
 
 		 140 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 184 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 157 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 155 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 		 155 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 162 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 171 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 153 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 173 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 140 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 162 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 165 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  24.62 
 
 		 163 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 157 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  29.56 
 
 		 152 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.66 
 
 		 171 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 163 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 173 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 184 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  21.85 
 
 		 177 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 156 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 150 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 162 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 152 aa  46.2  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  23.08 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 180 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  29.68 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.51 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>