42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3775 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  67.55 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.03 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.16 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  25.46 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  25.15 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  25.45 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.01 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  24.32 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  25.94 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  26.48 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  24.26 
 
 		 173 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.95 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 146 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  24.26 
 
 		 173 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.62 
 
 		 153 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30.28 
 
 		 153 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  31.53 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 		 141 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 		 173 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 143 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 155 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  26.06 
 
 		 154 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 162 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  27.59 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 134 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 155 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 		 184 aa  43.5  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 141 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.35 
 
 		 154 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 124 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 143 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.34 
 
 		 141 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 		 157 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>