More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8204 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
331 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.77 
 
 
329 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  35.74 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
343 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6860  AsnC family transcriptional regulator  31.42 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.13 
 
 
346 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  30.84 
 
 
329 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
338 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  28.62 
 
 
327 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
161 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
164 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
162 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.67 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2661  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.85 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
162 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
159 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  26.01 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
184 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  23.51 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
156 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 
168 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  24.61 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
172 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
172 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
172 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
173 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
176 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
176 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
176 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  24.43 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
162 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
168 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
164 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
153 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  24.26 
 
 
143 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
155 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 
167 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
152 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
167 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
167 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 
168 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
176 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.94 
 
 
168 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
158 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
154 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  27.91 
 
 
150 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
159 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  24.09 
 
 
140 aa  55.8  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
156 aa  55.8  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  25.74 
 
 
161 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  26.75 
 
 
172 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  24.43 
 
 
150 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
166 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
166 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
156 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  26.43 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
166 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
155 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
155 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.37 
 
 
181 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
162 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
151 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  34.26 
 
 
171 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
145 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  24.82 
 
 
174 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 
151 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 
162 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
149 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
153 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
153 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
162 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
174 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 
157 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  25.36 
 
 
160 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>