More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2186 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
173 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  52.67 
 
 
162 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 
168 aa  157  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 
162 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
173 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  47.47 
 
 
161 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 
164 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 
159 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 
176 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 
176 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 
176 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 
184 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 
165 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.85 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
162 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
171 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
164 aa  130  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
165 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  35.67 
 
 
163 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
157 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
360 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
302 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  32.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.23 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
156 aa  72  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.97 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  37.61 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  32.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  31.79 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.87 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.21 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.58 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.54 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.9 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.58 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.58 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.58 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.37 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.37 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  29.34 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  31.33 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>