More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3398 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
165 aa  333  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  73.91 
 
 
164 aa  239  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  71.88 
 
 
161 aa  236  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  69.18 
 
 
164 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  73.47 
 
 
159 aa  224  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  73.61 
 
 
171 aa  224  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  66.26 
 
 
171 aa  222  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  68.32 
 
 
162 aa  222  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
173 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  67.52 
 
 
173 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  67.33 
 
 
162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  63.52 
 
 
162 aa  209  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  68.67 
 
 
164 aa  208  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  69.39 
 
 
176 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  69.39 
 
 
176 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  69.39 
 
 
176 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  65.07 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  63.01 
 
 
168 aa  195  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  62.03 
 
 
184 aa  193  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  67.59 
 
 
165 aa  191  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 
177 aa  147  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 
163 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
302 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
360 aa  104  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
308 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
299 aa  87  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 
291 aa  77.4  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  33.33 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.61 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.39 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.39 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.39 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.39 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
329 aa  70.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.39 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.39 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.97 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.66 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.66 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.66 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.66 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.99 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  29.01 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  28.99 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.89 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.26 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.2 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.47 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.47 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
331 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  29.92 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>