More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4074 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 291 aa  553  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.15 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  35.84 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 148 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 155 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 164 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 173 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 155 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  39.23 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  32.9 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.93 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.23 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 		 145 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 143 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 140 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 140 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  25.85 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  34.09 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  28.29 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 143 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  33.86 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.08 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  26.32 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.11 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.37 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  32.46 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.1 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.63 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  34.22 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>