More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0574 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  70.27 
 
 		 162 aa  205  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  71.23 
 
 		 164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.74 
 
 		 164 aa  197  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  66.21 
 
 		 159 aa  194  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  62.03 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  61.88 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  64.43 
 
 		 171 aa  190  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  62.91 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  61.64 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  62.33 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 161 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 157 aa  94.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 308 aa  91.3  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 		 302 aa  87.8  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 360 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  33.33 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 299 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.37 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  25.52 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.06 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.34 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.19 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.62 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.62 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.62 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.62 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.25 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.61 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.9 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.9 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.46 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  42.34 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.48 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  32.46 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  33.83 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.46 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.46 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.46 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.46 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.46 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0235  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.07 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  35.19 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>