More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0235 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0235  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 176 aa  356  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1837  transcriptional regulator, AsnC family  65.82 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390205  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  30.97 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  30.57 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  25.83 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  24.83 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  27.42 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.42 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.01 
 
 		 329 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  27.94 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  29.46 
 
 		 308 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  26.97 
 
 		 291 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  24.2 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  29.2 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  29.09 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0349  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0342  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  24.5 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.46 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  27.82 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 328 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>