More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0002 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  65.64 
 
 		 163 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  65.64 
 
 		 163 aa  228  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  62.58 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 163 aa  173  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 163 aa  156  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 178 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  41.51 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  41.51 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 162 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  40.12 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  34.39 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  29.53 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  29.33 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  25.34 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  26.17 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  28.29 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  26.03 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>