156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1837 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1837  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390205  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0235  AsnC family transcriptional regulator  65.82 
 
 
176 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  32.38 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  30.56 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  31.19 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
157 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.47 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
156 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  28.16 
 
 
159 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
156 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  29.17 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
329 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  24.56 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  23.78 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.34 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  27.5 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  24.69 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  23.12 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0342  transcriptional regulator  26.36 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0349  transcriptional regulator  26.36 
 
 
151 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.183351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  27.72 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  24.34 
 
 
167 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  26.75 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  29.33 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  31.09 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  27.72 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  27.95 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  20.89 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  23.12 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  21.18 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  26.99 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  23.12 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  23.12 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  23.12 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  26.42 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  24.55 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  23.12 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  23.9 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  22.64 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  22.64 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  22.64 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  27.68 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  21.88 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  27.05 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  24.84 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  26.72 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  30.83 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  27.45 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  25.95 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  31.73 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  27.93 
 
 
360 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  22.38 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  21.53 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  28.1 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.51 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  23.36 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  24.75 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  24.22 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  24.77 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>